與印第安事務的權限全權歸屬于聯邦政府的處理方式有所不同，美國對黑人奴隸制的處理是由各州負責的，這就使得奴隸制的存廢成為南方蓄奴州與北方自由州之間不斷角力的關鍵點之一，而聯邦政府的傾向性則具有重要的意義和價值。在林肯當選美國總統后，以南卡羅來納和佐治亞為首的南部7個蓄奴州于1861年2月4日宣布集體脫離聯邦并建立南部邦聯。林肯在1861年3月4日宣示就職時明確表示要維護國家的統一：“任何州均不能單憑自己的動議合法地退出聯邦；任何為此而通過的決議和法令在法律上都是無效的；任何一州或者幾個州反對聯邦當局政府的暴力行為都可以根據情況看作叛亂的或革命的”；“因此，我認為，從憲法和法律上來看，聯邦是不容分裂的；按照憲法本身明確賦予我的職責，我將竭盡全力確保聯邦法律在各州都得以忠實執行”。[73]1863年1月1日，林肯在《解放宣言》中宣布“任何一州之內或一州的指明地區之內作為奴隸被占有的人，都應在那時及以后永遠獲得自由”。[75]1865年，美國國會在南北戰爭結束后通過《憲法第十三條修正案》，規定“在合眾國境內或屬合眾國管轄的任何地方，不準有奴隸制或強制勞役存在，惟用于業經定罪的罪犯作為懲罰者不在此限”；1866年，美國國會通過第一部民權法案，規定“不管種族和膚色，也不管在此之前是奴隸還是非自愿仆役”與否，所有在美國出生的人都是美國公民；在1868年，美國國會在《憲法第十四條修正案》中對各州的權利予以限制，依據該法案，各州不得指定任何限制公民特權和豁免權的法律，各州不經正當法律程序不得剝奪任何人的生命、自由和財產，各州不得拒絕給予任何人以“平等的法律保護”。1869年，美國國會經由《第十五條修正案》宣布“合眾國公民的選舉權，不得因種族和膚色或以前是奴隸而被合眾國或任何一州加以拒絕和限制”。經由美國南北戰爭和戰后的三個憲法修正案，美國黑人的奴隸制被徹底廢止，美國建國初期關于黑人奴隸選舉權的“3/5原則”也由此失去效力；也恰因如此，這三個憲法修正案由此被歷史學家們稱之為“美國的第二個聯邦憲法”。[76]

　　在亨廷頓看來，南北戰爭對于美國和美利堅國族構建而言意義極其重要：“它確實造就了一個國家(a nation)。還造就了美利堅民族主義、愛國主義以及美國人對自己國家的無保留的認同”。[77]這種構建與打造，顯然要歸功于林肯基于多民族國家的整合需要而不得不對擴大美利堅國族的包容性的舉措。首先，林肯把白人內部關于奴隸制的爭論和征戰視為美利堅國族內部的“一場民族大內亂”。[78]其次，林肯明白地拒絕在國族內部展開“敵我辨識”，“我們不是敵人而是朋友。我們一定不要成為敵人。雖然目前的情緒可能有些緊張，但一定不要使我們之間親密情誼的紐帶破裂”。[79]再次，林肯堅持認為美利堅國族是一個包容各族裔的“民族家園”，“美國人民在地球上占有和居住的這片土地只適合作為一個民族大家庭的家園，而不能作為兩個或兩個以上民族大家庭的家園。它那廣闊的幅員和多樣化的氣候和物產在過去不管曾對多少個民族有利，現在卻只對一個民族有利。隨著蒸汽機、電訊等現代發明的到來，一個統一的民族會具有更大的優越性”；“我們國家的內亂不是起源于我們居住的土地，不是起源于我們民族的家園。要分離就只會使我們中的災難增加而不會減少。就它的一切適應力和自然傾向來說，只能聯合，不能分裂”。[80]