來自制度層面的不信任，挫傷了很多科研人員的積極性

　　時時要面對“無償”、“墊付資金”、報銷程序復雜繁瑣的科研項目，科研人員自然很難有做好研究的內在動力。相當數量的具有高級職稱的科研人員已選擇放棄項目申請，這便是證明。

　　由于項目經費中使用的每一筆錢都受到了嚴格的監督和審核，任何一位守法的科研人員基本上沒有違法亂用科研經費的可能性。也就是說，目前的科研經費管理制度基本上遏制了科研人員違規使用科研經費或其他浪費科研經費的現象。

　　但是，實施這些措施同樣會產生嚴重的消極影響，即有可能讓一位守法的研究人員鋌而走險成為非法套用科研經費的“犯罪分子”。

　　第一，這些措施使科研人員失去了申請課題、高質量地做好研究的內在動力，因而也嚴重挫傷了科研人員從事項目研究的積極性。

　　科研人員基本上是利用自己的業余時間從事項目研究工作，在絕大多數情況下，還要自己先墊付資金從事項目研究。

　　現行的科研經費實行“報銷制”，科研人員不能直接使用其項目經費采購計算機、復印機，或購買飛機票等。為了使用項目經費，必須首先向所在單位提出相應的使用申請，說明申請經費的用途、額度，然后層層報批。許多科研人員為了省卻這些復雜的程序，通常自己墊付上述費用，然后再憑發票、采購清單等到單位財務部門申請報銷，取回墊付的資金。這樣，墊付時間的長短就從幾周到數月不等。

　　科研人員也是正常人，也有家庭。在目前的社會環境下，要求他們時時面對這種“無償”、“墊付資金”、報銷程序復雜繁瑣的科研項目，自然很難有申請課題、做好研究的內在動力。相當數量的具有高級職稱的科研人員已選擇放棄項目申請，這便是證明。即使青年學者申請課題，多數人的目的并不是為了科研，而是為了職稱。因為擁有課題，尤其是縱向課題，是他們晉升職稱的必備條件之一。

　　第二，現有制度沒有為項目研究創造一個寬松、自由的良好學術環境。

　　所謂寬松、自由的學術環境，首先必須為科研人員提供一份足以使其本人和其家人能過上體面的、有尊嚴生活的薪酬。如果一個科研人員的薪酬很低，必須時常為支付下個月房租或房貸的資金來源而操心，他自然難以安心從事科研工作。加上我國現行的科研經費管理和報銷制度在本質上蘊含著對廣大科研人員的不信任，科研人員的心情不會十分舒暢、愉悅。帶著怨氣或其它負面情緒進行研究，是難以產出高質量的科研成果的。

　　寬松、自由的學術環境還意味著:管理和報銷制度應該盡可能地簡化報銷手續，這樣科研人員可以盡量少地將其時間花費在報銷上，而是將更多的精力投入在項目研究上。但是，現有科研經費管理和報銷制度十分繁瑣、復雜。為了應對這種復雜和繁瑣的制度，科研人員一方面必須將幾百張或幾千張發票、刷卡消費憑證、購物清單分門別類并按照財務規定進行粘貼，這需要花費相當數量的時間和精力。有些課題組甚至花錢聘請專人負責報銷工作。就有報道披露，某環境學專家在撰寫結項報告時，大約花了3個月時間整理準備各項財務支出清單，他必須為其花費的每一筆錢都附加相應票據并說明其用項。正因如此，每個科研人員都自嘲自己已經成為“會計專家”了。另一方面，每次報賬，科研人員還須花費大量時間。目前各單位財務部門成為最忙的機構之一，排隊報賬的隊伍堪比春節期間排隊買火車票，等候半天是十分正常的現象?？蒲腥藛T在白天也只有8個小時，用在報銷上的時間愈多，用在科研上的時間就愈少。

　　第三，現有科研經費管理和報銷制度還具有負面作用。

　　在項目研究過程中，科研人員實際支付了一些費用，但由于這些費用不符合報銷制度，不能報銷。科研人員自然會通過另外提供一些允許報銷的發票，并從項目經費中報銷這些發票，以便收回自己為項目實際支付的費用。這種行為即便能夠被理解，但顯然屬于違法行為。

　　照現有科研經費管理規則，在項目結束并順利通過結項審查后，剩余的項目經費便歸項目負責人支配。由于不能為項目負責人和其他課題參與者支付報酬，為用完這些剩余的資金，項目負責人只能設法收集一些允許報銷的發票套取現金。從科研人員角度來分析，他這么做有許多充分的合法的理由。例如，他已經完成了項目委托方在合同中約定的科研任務，既然如此，他理所當然地自由提取這些資金;然而，在項目執行過程中，他沒有獲得任何報酬，這并不符合長期實行的、為　《勞動法》　確認“按勞分配、多勞多得”的分配原則;所以，在科研人員看來，項目結束通過提供各種發票套取現金給各位項目參與者支付一些報酬，也是合理合法的。但根據我國現有科研經費管理和報銷制度，這也是違法行為。

　　綜上所述，我國現行科研經費管理和報銷制度具有兩面性，它既有遏制濫用、浪費科研經費的功能，但同時有損我國廣大科研人員從事項目研究的積極性，甚至有促使他們違規套取項目經費的作用。