在中國(guó)的國(guó)家治理體系中，政府系統(tǒng)是實(shí)現(xiàn)治理的主要載體，黨的領(lǐng)導(dǎo)通過政府體系來實(shí)行。政府體系的結(jié)構(gòu)分為體制和機(jī)制兩個(gè)部分。體制是指正式的機(jī)構(gòu)，包括各個(gè)層級(jí)的政府和每個(gè)層級(jí)政府的各個(gè)部門，以及承擔(dān)公共管理職能的政府附屬機(jī)構(gòu)。機(jī)制是以一定的運(yùn)作方式把事物的各個(gè)部分聯(lián)系起來，使它們協(xié)調(diào)運(yùn)行而發(fā)揮作用的制度安排。政府體系內(nèi)的機(jī)制包括政府部門之間、各級(jí)政府間、平行政府間，以及政府與事業(yè)單位、社會(huì)組織及公民個(gè)人之間的溝通、協(xié)商、共同行動(dòng)，乃至糾紛裁決等制度安排。

　　國(guó)家治理體系的中間環(huán)節(jié)

　　中國(guó)的國(guó)家治理體系是一個(gè)多層級(jí)、多行政單位構(gòu)成的復(fù)雜體系。中國(guó)政府的體制在縱向從中央到鄉(xiāng)鎮(zhèn)有五個(gè)層級(jí)，在橫向有省級(jí)政府之間、省級(jí)以下的市（地區(qū)）之間、縣（市）之間，以及省與外省的市（地區(qū)）之間、市（地區(qū)）與非本市（地區(qū)）的縣（市）之間的關(guān)系。這個(gè)復(fù)雜體系在運(yùn)行過程中，除了依據(jù)行政隸屬關(guān)系和行政轄區(qū)的行政行為之外，還有大量的跨行政層級(jí)和跨行政區(qū)的行政活動(dòng)。前者是指高級(jí)別的政府或部門對(duì)低級(jí)別的政府或政府部門跨層級(jí)的領(lǐng)導(dǎo)、指揮，比如為實(shí)現(xiàn)某項(xiàng)重大治理任務(wù)而建立的“領(lǐng)導(dǎo)小組”，其成員不僅有一級(jí)政府的領(lǐng)導(dǎo)人、相關(guān)部門的負(fù)責(zé)人，還包括所轄下一級(jí)政府的領(lǐng)導(dǎo)人和相關(guān)部門的負(fù)責(zé)人。后者是指地方政府間或政府部門間的協(xié)調(diào)與合作，比如地方間的合作協(xié)議、部門間的聯(lián)合發(fā)文等。因此中國(guó)的政府體系里存在亞層級(jí)和跨行政區(qū)治理機(jī)制，這些中間性的治理機(jī)制的主要功能是跨部門治理和區(qū)域治理。

　　作為國(guó)家治理體系的中間環(huán)節(jié)，區(qū)域治理發(fā)揮著獨(dú)特的作用。在中國(guó)，區(qū)域是國(guó)家與地方之間的中間層次，位于縱向政府層級(jí)體系中某兩個(gè)層級(jí)間，例如長(zhǎng)三角區(qū)域位于中央與滬浙蘇三省市間。區(qū)域的范圍大小不一，但都涵蓋了若干行政區(qū)。國(guó)家的空間發(fā)展戰(zhàn)略以區(qū)域?yàn)檩d體，中國(guó)的區(qū)域發(fā)展總體戰(zhàn)略就是把全國(guó)分為東中西和東北四大板塊。由于區(qū)域位于政府層級(jí)的中間，又是跨行政區(qū)的，區(qū)域治理無(wú)法直接使用政府體制，而是以機(jī)制方式，通過不同層級(jí)和不同地方政府間的溝通、協(xié)商和合作來實(shí)現(xiàn)。跨層級(jí)的政府合作和跨行政區(qū)的地方合作共同構(gòu)成區(qū)域治理的內(nèi)容，中央、區(qū)域、地方共同構(gòu)成國(guó)家治理體系的空間結(jié)構(gòu)，區(qū)域治理需要中央與地方共同參與，需要不同地方政府間的合作。多方參與形成有效的區(qū)域治理是國(guó)家治理能力的一種重要標(biāo)志。