在常用的社會(huì)科學(xué)方法中，訪談?wù){(diào)查時(shí)訪談?wù)叩奶卣?知識(shí)面、性格和價(jià)值觀)、被訪談?wù)叩奶卣饕约皟烧咧g的互動(dòng)方式都得不到有效的控制;參與式觀察所能觀察到的往往是研究者的感官能夠和愿意接受的信號(hào);歷史文獻(xiàn)方法面對(duì)的是一大堆前人帶著不同目的而留下的材料;網(wǎng)絡(luò)方法在取樣上有許多方面難以得到有效控制，而且因?yàn)槠渥⒁饬χ泻苌儆芯W(wǎng)絡(luò)關(guān)系的內(nèi)容，研究結(jié)論往往是只見樹木不見森林;問卷調(diào)查最多只“控制”了問卷設(shè)計(jì)者注意到的和想控制的“變量”，并且調(diào)查結(jié)果會(huì)顯著地受到提問方式的影響;博弈論方法作出的是給定社會(huì)機(jī)制和前提條件下的演繹，卻完全不能保證任何相關(guān)社會(huì)現(xiàn)象的確是在按演繹邏輯發(fā)展。行動(dòng)者計(jì)算機(jī)模擬法(agent-based simulation)對(duì)環(huán)境、社會(huì)機(jī)制和人的行為模式都作設(shè)定，模擬結(jié)果基本上只有啟發(fā)意義。

　　上述這些社會(huì)科學(xué)方法中，有的倚重經(jīng)驗(yàn)歸納，有的倚重邏輯演繹，但都不是自然科學(xué)意義上的控制實(shí)驗(yàn)。由于實(shí)驗(yàn)方法在社會(huì)科學(xué)中的應(yīng)用極其有限，在生物學(xué)中達(dá)到的兩個(gè)統(tǒng)一，在社會(huì)科學(xué)就變成了兩個(gè)分離(演繹和歸納的分離，為什么問題和怎么樣問題的分離)。這給社會(huì)科學(xué)研究帶來了重大挑戰(zhàn)。

　　演繹和歸納的分離給了社會(huì)科學(xué)兩個(gè)十分常見的邏輯錯(cuò)誤。(1)把演繹結(jié)論當(dāng)作經(jīng)驗(yàn)總結(jié)。這一點(diǎn)在經(jīng)濟(jì)學(xué)中最甚，其次是政治學(xué)。例如奧爾森(Olson 1965)的搭便車?yán)碚?即“三個(gè)和尚沒水喝”這一諺語的理論表達(dá))，它明明是一個(gè)在多種假設(shè)條件下可以通過演繹而得出的社會(huì)機(jī)制，就像馬爾薩斯方程是一個(gè)在多種假設(shè)條件下可以通過演繹而得出的單種群動(dòng)態(tài)模型一樣，但奧爾森卻煞有其事地把它描述成一個(gè)似乎是從經(jīng)驗(yàn)現(xiàn)象中總結(jié)出來的、具有廣適性的理論。而他的反對(duì)者也煞有其事的通過經(jīng)驗(yàn)事實(shí)試圖否定奧爾森的搭便車?yán)碚摚渲杏腥诉€為此拿了諾貝爾經(jīng)濟(jì)學(xué)獎(jiǎng)(Ostrom 1990) 。在生物學(xué)中，如果有個(gè)大學(xué)生想寫本科畢業(yè)論文，聲稱想通過證據(jù)來證明馬爾薩斯方程不能預(yù)測(cè)任何一個(gè)種群的動(dòng)態(tài)，指導(dǎo)老師會(huì)馬上否定這一想法。但是，在生物學(xué)中連大學(xué)畢業(yè)論文都不能作的課題在社會(huì)科學(xué)中卻能拿諾貝爾獎(jiǎng)。這類現(xiàn)象比比皆是。(2)對(duì)局部經(jīng)驗(yàn)現(xiàn)象進(jìn)行演繹。例如，黑格爾根據(jù)他非常有限的歷史認(rèn)識(shí)就提出了著名的線性史觀，而后人則進(jìn)一步把黑格爾的線性史觀演繹成通向歷史終結(jié)的“康莊大道”。黑格爾和他的追隨者只不過是走入了一個(gè)任何社會(huì)科學(xué)家都很難避免的誤區(qū)：把局部知識(shí)當(dāng)作歷史經(jīng)驗(yàn)，把最為符合自己價(jià)值觀的“變量”和相應(yīng)機(jī)制當(dāng)作廣義理論，把自己的眼睛當(dāng)作了世界。

　　演繹和歸納的分離還使得“理論”在社會(huì)科學(xué)中嚴(yán)重地喪失了經(jīng)驗(yàn)意義。在傳統(tǒng)的自然科學(xué)的意義上，理論指的是數(shù)個(gè)在邏輯上相互關(guān)聯(lián)的，能用來解釋一類經(jīng)驗(yàn)現(xiàn)象的命題(propositions)。這些命題的核心既可以是法則也可以是機(jī)制。牛頓定律是理論，因?yàn)樗苡脕斫忉寧缀跛械慕?jīng)典力學(xué)意義上的物理現(xiàn)象，DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)是理論，因?yàn)閺倪@一化學(xué)結(jié)構(gòu)產(chǎn)生出的化學(xué)機(jī)制能用來解釋許多生物化學(xué)現(xiàn)象。即使是馬爾薩斯方程，它也可以看作是一個(gè)理論，因?yàn)樗辽倌芙忉屧趯?shí)驗(yàn)室條件下的單個(gè)種群的增長(zhǎng)模式。但是，演繹和歸納的分離使得絕大多數(shù)傳統(tǒng)意義上的社會(huì)科學(xué)理論做不到這一點(diǎn)。